NextSeq 1000 и NextSeq 2000

Системы секвенирования NextSeq 1000 и NextSeq 2000 представляют новейшие технологии Illumina для настольного секвенирования.  У приборов расширены области применения по сравнению с версией 550. NextSeq 1000 и NextSeq 2000 обладают более высокой точностью и меньшим количеством ограничений.

NextSeq 1000 и NextSeq 2000 обеспечивает большую производительность для более глубокого изучения и инновационных открытий за счет значительного сокращения затрат на секвенирование, большей гибкости и упрощенных рабочих процессов, минимизирующих потребность в дополнительных ресурсах.

Высокая производительность с возможностью масштабирования

Системы NextSeq 1000 и NextSeq 2000 позволяют значительно сократить затраты на секвенирование по сравнению с другими настольными платформами секвенирования. А вторичный анализ выполняется всего за 2 часа. 

Простой, интуитивно понятный рабочий процесс для оптимизации времени и ресурсов

Системы NextSeq 1000 и NextSeq 2000, входящие в сегмент секвенаторов средней производительности, имеют широкий спектр применений - они подходят для секвенирования экзомов, транскриптомов, таргетного секвенирования с обогащением, профилирования отдельных клеток и многого другого. Рабочий интерфейс интуитивно понятен благодаря визуальным подсказками о выполнении процесса запуска.

Достижение новых прорывов

Системы NextSeq 1000 и NextSeq 2000 осуществляют экономически выгодное высокопроизводительное секвенирование и обеспечивают точные результаты. 

Удобная система работы с картриджами

Системы секвенирования NextSeq 1000 и NextSeq 2000 используют встроенные картриджи, в которые уже включены реагенты, флюидика и отходосборник, что упрощает загрузку библиотек и использование инструмента. Необходимо просто разморозить картридж с реагентами, вставить проточную ячейку в картридж, загрузить библиотеку в картридж и вставить заполненный картридж в прибор.

В дополнение к простоте использования, конструкция картриджа повышает точность секвенирования, снижает затраты и минимизирует объем отходов.

б

Интеграция с платформой DRAGEN Bio-IT

Платформа DRAGEN Bio-IT (Dynamic Read Analysis for GENomics - Динамический анализ прочтений для геномики) осуществляет сверхбыстрый и точный вторичный анализ. Платформа DRAGEN использует оптимизированные аппаратно-ускоренные алгоритмы для широкого спектра возможностей геномного анализа, включая преобразование BCL, картирование генов, выравнивание, сортировку, маркировку дубликатов и определение вариантов. Встроенное решение обеспечивает пользователям доступ к выбранным программам анализа DRAGEN, позволяя  получать результаты всего за два часа. Информатика DRAGEN использует одни из самых передовых алгоритмов, чтобы помочь  как начинающим, так и опытным пользователям преодолеть сложности в анализе данных и уменьшить необходимость обращаться к сторонним экспертам по информатике. Благодаря этому пользователи будут тратить меньше времени и усилий на проведение анализа и могут сосредоточиться на результатах.

Экосистема приложений в BaseSpace Sequence Hub

Пользователи, которые предпочитают проводить анализ в облаке, могут воспользоваться BaseSpace Sequence Hub, платформой облачных вычислений для геномики. В облаке пользователи могут получить доступ к широкому выбору инструментов биоинформатики и обмениваться данными по всему миру. Данные, сгенерированные системами NextSeq 1000 и NextSeq 2000, совместимы со стандартными форматами для удобного импорта.

Спецификации NextSeq 1000/2000

  NextSeq 1000/2000 P2 Reagents NextSeq 2000 P3 Reagents
Длина прочтения Общее время, ч
Производительность, Gb Общее время, ч Производительность, Gb
2 × 50 п.о.
~ 13
40
~ 19
100
2 × 100 п.о. ~ 21
80 ~ 33
200
2 × 150 п.о. ~ 29 120 ~ 48 300

Показатели качества

Длина прочтения NextSeq 1000/2000 P2 Reagents
NextSeq 2000 P3 Reagents
2 × 50 п.о. ≥ 85% оснований выше, чем Q30
2 × 100 п.о. ≥ 80% оснований выше, чем Q30
2 × 150 п.о. ≥ 75% оснований выше, чем Q30  

Загрузка прибора для ключевых применений

  NextSeq 1000/2000 P2 Reagents NextSeq 2000 P3 Reagents
  Общее время, ч
Количество образцов Общее время, ч Количество образцов
Полногеномное секвенирование (малые геномы)
300 циклов; 130 Mb генома; покрытие >30х 
~ 29
30
~ 48
75
Полноэкзомное секвенирование
200 циклов; 50-кратное покрытие среднего таргета; 90% покрытие таргета при 20х 
~ 21
16 ~ 33
40
Single-cell RNA-Seq
100 циклов; 4000 клеток; 50000 ридов/клеток
~ 13 2 ~ 19 5

Рабочий процесс
Подготовка библиотек:
У NextSeq 2000 расширены области применения по сравнению с версией 550.
Секвенирование:
Система относится к сегменту средней производительности
Анализ данных:
Быстрый, точный анализ данных с возможностью загрузки в облако